崇祯帝继位之初，为了迷惑阉党，对待阉党的态度一如天启帝在位时一样，该赏的赏该荫官的荫官，就连天启帝原本预备赐给魏忠贤的匾额也照旧赐予了，并且还在处理朝政时依旧听取王体乾、魏忠贤等人的意见，仿佛一切都没有改变一样。
但有一朝天子一朝臣的惯例在，王体乾、魏忠贤等人依旧担心崇祯帝会拿自己开刀，所以基于以退为进的斗争模式，天启七年九月初一那天，魏忠贤便向崇祯帝提出了辞去提督东厂差事的请求。
在崇祯帝看来，魏忠贤不从司礼监退出，光辞去一个厂臣，明显是有试探的用意在，所以他断然的否决了魏忠贤的辞职请求，并且好言慰问。
只是魏忠贤还是心定不下来，所以便让奉圣夫人客氏提出了离宫的请求，这次，崇祯帝毫不犹豫的答应了，一下子让客氏感到了极度的失落和不安，然而离宫请求是客氏自己提出来的，是不好再收回来的，否则就是正儿八经的欺君了，所以，无可奈何之下，客氏只好满腹担心的搬离了紫禁城。
慰留自己，却不慰留客氏，这让魏忠贤心里直打鼓，但崇祯帝不留客氏也是有道理的，毕竟，魏忠贤是天启帝临终前专门跟崇祯帝交代过要重要的，而客氏却只是兄长的乳母而已，做弟弟让她留在身边，传出去也有些不像话了。
然而越是看上去正常，阉党这边越是心里没底，所以，隔了几天王体乾又上疏请求辞职，籍此进一步试探崇祯帝的心意，只是崇祯帝继续慰留，让阉党上下根本摸不清崇祯的意图。
九月二十五日，魏忠贤憋出一个大招来，再次试探崇祯帝，这一次，他请求崇祯禁止各地为自己继续修建生祠。
对于魏忠贤的这个要求，崇祯帝回复道：“已经造好的就算了，接下来可以不用再造了，免得浪费了国家宝贵的资金。”
或许觉得这种说法不能让阉党安心，所以崇祯帝又道：“给魏忠贤建生祠是舆论对魏忠贤功劳的认可，现在魏忠贤有功不居，自愿阻止各地继续建筑生祠，这是品德高尚的表现，朕要成人之美的！”
所谓解释就是掩饰，崇祯帝这番不说还好，说了，怎么听都有一种欲盖弥彰的味道，所以五天后，阉党便把原本压在手中的一封奏疏递进了紫禁城，在这封奏疏中，江西巡抚杨邦宪，江西巡按刘述祖称魏忠贤“功德巍巍”，申请在江西帮魏忠贤造更多的生祠。
崇祯帝看完了，笑意盈盈，却不转交内阁拟票，只是说道：“之前已经有相关的旨意了，这封奏疏就留中吧。”
阉党这才发现，自己又吃了一个哑巴亏，无可奈何之下，魏忠贤只能求到了徐应元跟前，徐应元与魏忠贤早年也是赌桌上的赌友，所以，魏忠贤想靠着这点老关系，能弄清楚崇祯帝对阉党的真实态度，然而徐应元却虚与委蛇，误导了阉党上下。
再加上，崇祯帝对阉党成员、工部尚书杨梦衮的辞职又加以再三慰留，这就让阉党上下略微松了一口气；却没曾想，崇祯帝所作的一切其实都是为了迷惑阉党，这不，在让阉党放松警惕的同时，崇祯却一直在加强自身的防范，并将徐应元等信王府内监调入宫中，安插在重要的位置之上，并根据李朝钦、裴有声、王秉恭等阉党成员的请求，先后允许其致仕，如此便在不经意间，悄悄剪除了不少阉党的羽翼。
正当崇祯帝在不动声色中，逐步削弱阉党的力量，为消灭阉党最积累的时候，阉党内部却爆发了矛盾。
说起来，阉党系由齐楚浙三党的残余拼凑而成的，本身是有矛盾的，因此在权力分配时，自然是有人得的多，有人拿的少，不可能一碗水端平的，因此，拿得少人就觉得在现在的形势下，阉党完蛋是大概率的事，不如把罪过退到部分得利更多的人头上，如此一来，或可以让大部分人金蝉脱壳，并籍此收拾残局。
所以，时任南京通政司通政使的阉党成员杨所修便伙同吏科给事中陈尔翼、都察院御史李蕃等人上书攻击阉党中最出挑的崔呈秀、周应秋，想让这两人成为整个阉党的替罪羔羊；但崔呈秀肯定不会接受被同党出卖的结局，所以倒打一耙，一时间，阉党内部开始狗咬狗起来，这就让更多的阉党成员觉得大势已去。
正当阉党上下，认为崇祯帝会趁机出手之际，崇祯帝却不想贸然出手，进而打乱了他消除阉党的计划，并造成朝局的混乱，所以，依旧保持了引而不发的状态。
对于崇祯帝依旧没有出手的做法，阉党高层松了一口气，认为崇祯帝刚刚上台还没有能力厘清朝局，抽出手对付盘根错节的阉党；但在另外一批人眼里，却得出了另外的判断----他们觉得崇祯帝不出手是因为阉党内部的矛盾还不激烈，所以才会继续以静制动。
于是，早年投靠阉党，却没被阉党重用的云南道御史杨维垣在慎重考虑之后，认为事不宜迟，当立刻倒戈，所以杨维垣很快就连上多道弹章，弹劾崔呈秀。
由于李蕃等人弹劾崔呈秀的先例在，阉党内部不少人已经得出了“倒了崔呈秀，幸福一群人”的结论，故而，没有人去救崔呈秀，在此情况下，孤立无援的崔呈秀便只能再三请旨自辞，崇祯帝此时顺水推舟，崔呈秀就这样垮台了。
崔呈秀一倒，立刻引起了连锁反应，看到阉党已经一团散沙之后，东林等阉党反对派便立刻如同打了鸡血一样兴奋起来，纷纷开始上疏攻击阉党，矛头直指魏忠贤。
魏忠贤“震恐伤魄”，立即去找他的赌友徐应元，讨教对策。
徐应元便劝魏忠贤辞去一切差事，也许可以保富贵。
次日，被徐应元忽悠瘸了的魏忠贤向崇祯帝请求病休，崇祯帝便同意了魏忠贤“私家调理”，至此，魏忠贤放弃了最后的抵抗，阉党的覆灭也由此进入了倒计时······
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