在某个平行宇宙的地球上，日本长期无节制地开采资源，对环境造成了毁灭性的破坏。
随着生态的崩溃，大量形态各异、能力恐怖的怪兽从黑暗的角落中涌出，它们在城市间横冲直撞，所到之处，高楼崩塌，火光冲天，人类的生命和文明危在旦夕。
为了应对这场突如其来的危机，人类迅速组建了祸特队，肩负起保卫地球、对抗怪兽的艰巨使命。
然而，祸特队很快发现，人类现有的武器在日益强大的怪兽面前，显得无比渺小和无力。
这些怪兽不仅拥有坚硬的外皮，能够轻松抵御炮火的攻击，还具备各种诡异的能力，如发射激光、释放毒雾等。
与此同时，各种心怀恶意的外星人也纷纷盯上了地球，他们或亲自降临，或操纵怪兽，给人类带来了更为复杂和严峻的挑战。
在这生死存亡的关头，人类科学家为了寻求一线生机，不得已开启了“潘多拉魔盒”研究一些会对环境造成严重破坏的大威力杀伤性武器，但结果却并不如他们所愿。
就在人类陷入绝望之时，一道银色的光芒划破了黑暗的天际，初代奥特曼降临地球。
他如同一道希望的曙光，以强大的力量瞬间消灭了让人类束手无策的怪兽内隆嘎。这一壮举引起了全宇宙文明的关注，无数双眼睛聚焦到了这个在宇宙中原本毫不起眼的蓝色星球上。
然而，初代奥特曼在消灭怪兽的过程中，却无意间害死了祸特队的神永新二。
怀着深深的愧疚，初代奥特曼做出了一个大胆的决定——与神永新二一心同体。在光芒的交织中，银色的巨人变成了红银双色的巨人。
这一变化虽然让奥特曼的力量得到了进一步提升，但却违背了光之国的禁令。
因为这一行为，无疑向全宇宙宣告，人类是制造生物武器的绝佳材料。
消息一经传出，众多宇宙文明纷纷将贪婪的目光投向了地球，人类瞬间沦为了他们眼中制造生物武器的理想素材。
在这危机四伏的环境下，一只新的怪兽突然出现在城市中，肆意破坏。神永感受到了人们的绝望，毫不犹豫地变身奥特曼，与怪兽展开了激烈的战斗。
奥特曼那令人惊叹的强大战斗力，不仅让人类高层为之震撼，更是让一些心怀不轨的外星人感到深深的恐惧。
然而，面对这个突然降临的奥特曼，人类高层却并未完全信任他。尽管奥特曼展现出了无与伦比的力量，但对于人类来说，这毕竟是一个来自外太空的未知存在，谁也无法确定他的真实意图和目的。
就在人类对奥特曼的态度还处于观望和怀疑之时，一个名为扎布拉星人的外星种族来到了地球。
他们以一种看似友好的姿态，与日本政府进行了接触，并迅速签订了一份和平条约。
扎布拉星人在条约中承诺，将帮助人类消灭奥特曼，从而解决地球所面临的危机。
这一承诺让人类高层感到既惊讶又欣喜，毕竟奥特曼的力量虽然强大，但也给地球带来了诸多不确定性。
然而，人类高层并没有意识到，扎布拉星人的真正目的并非如此简单。实际上，这些外星人内心隐藏着一个极其邪恶的计划——拉拢奥特曼加入他们，共同毁灭人类。
与此同时，神永本人变身视频的曝光犹如一颗重磅炸弹，在社会上引起轩然大波。
这个视频迅速传播开来，引发了公众的广泛关注和热议。人们对神永的真实身份产生了极大的好奇和猜测，而这也使得他的处境变得异常危险。
当神永识破扎布拉星人的阴谋并果断拒绝后，扎布拉星人并未善罢甘休。他心怀叵测，暗中策划着一场更为阴险的阴谋。一天夜晚，神永突然遭到不明身份的人袭击，被强行掳走。
为了实现他们的邪恶计划，扎布拉星人决定假扮成奥特曼，在城市中制造混乱和恐慌。
他们故意在人口密集的区域大肆破坏，摧毁建筑物、伤害无辜民众，给城市带来了巨大的灾难。这一系列恶行让人们对奥特曼的形象产生了严重的误解，认为奥特曼是一个残暴的侵略者。
人类高层在目睹这一切后，对奥特曼的信任瞬间崩塌。他们将奥特曼视为敌人，下令对其展开全面围剿。原本应该是保护地球的英雄，如今却成了众矢之的，被人类所唾弃和敌视。
就在这混乱之际，浅见收到了神永的来信和贝塔魔棒，得知了事情的真相。最终在队友的帮助下，浅见历经千辛万苦，终于找到了被关押的神永，并将神贝塔魔棒交还给了他。
神永通过这些天对人类种族的了解，他深爱着人类，并相信人类最终可以进化成与他们奥特一族相似的种族。
带着保护人类的决心，再次变身奥特曼，与假冒奥特曼的扎布拉星人展开了一场惊心动魄的决战。
在激烈的战斗中，奥特曼凭借着强大的实力和坚定的信念，最终将扎布拉星人打回原形，并将其击杀。然而，战斗结束后，浅见却神秘失踪了，给众人留下了一个巨大的谜团。
就在地球陷入一片混乱之时，林宇、莉莉博士与周浩然三人驾驶着星际飞船探索号，穿越时空虫洞，如流星般划过无尽的黑暗，最终抵达了这个神秘的平行宇宙。
他们的到来，仿佛是在平静的湖面投下了一颗巨石，激起了千层浪。
他们穿越平行宇宙所造成的巨大能量波动，也如同涟漪一般，迅速扩散开来。这股能量波动穿越了宇宙的边界，惊动了正在向地球赶来的佐菲奥特曼。
佐菲奥特曼，这位宇宙警备队的队长，感受到了这股异常的能量波动后，立刻意识到了事情的严重性。他毫不犹豫地改变了自己的航线，加速朝着能量波动的源头飞去。
佐菲奥特曼之所以突然来到地球，是因为初代奥特曼在地球上的所作所为，严重违背了光之国的禁令。
更为重要的是，这一事件让宇宙中所有掌握巨大化科技的外星人得知，地球人类是制造生物兵器的绝佳材料。
地球拥有多达数十亿的人口，一旦这些心怀不轨的外星文明得逞，将意味着多出数十亿强大的生物兵器，这无疑会对整个宇宙文明造成巨大的威胁。
为了防止这种可怕的后果发生，光之国决定派遣佐菲奥特曼带着最终武器芝顿，彻底毁灭地球人类，以绝后患。
林宇三人的任务就是帮助这个平行宇宙的地球，摆脱被光之国芝顿毁灭的命运，并彻底扭转光之国对地球人类的看法。
在经过一番深思熟虑后，林宇三人决定先与地球上的祸特队取得联系，了解地球的现状，并寻找解决问题的方法。