在成功摆脱熔岩队基地之后，陆辰稍作休整便毫不犹豫地踏上了新的征程，目标直指水舰队基地。
一路上，他风驰电掣般地疾驰，心中只有一个念头：一定要阻止水舰队的阴谋！
终于抵达水舰队基地附近，陆辰小心翼翼地避开巡逻的小喽啰，悄悄靠近基地入口。
然而，就在他准备潜入的时候，却听到两个小喽啰正在交谈。
其中一人说：“老大已经带着兄弟们去凯那市了，听说那里有大动作呢！”
另一人附和道：“是啊，这次肯定能让咱们水舰队扬名立万！”
得到这个重要情报后，陆辰没有丝毫耽搁，立刻调转方向朝着凯那市飞奔而去。
当他赶到凯那市的港口时，只见那里人头攒动，热闹非凡。
原来，一群记者和热情的观众正围着库斯诺吉馆长进行采访。
面对众多媒体的提问，库斯诺吉馆长镇定自若地回答道：“没错，尽管之前遇到了一些困难，但我们不会放弃探索未知的决心，接下来，我们将继续深入研究海洋的奥秘。”
正当陆辰想要上前与库斯诺吉馆长交流时，突然听到馆长提到了一则关键信息——在 128 号航道上存在着一个神秘的海底洞窟。
陆辰心头一震，直觉告诉他这或许就是解开谜题的关键线索。
于是，他跟着库斯诺吉馆主走进博物馆内。
可刚一进门，他们就被眼前的景象惊呆了：辛辛苦苦研制出来的潜水艇已经被水舰队控制了。
就在这时，水梧桐出现在了陆辰面前。
他冷冷地盯着陆辰，嘲讽道：“嗯？怎么又是你……”
话未说完，水梧桐便不再理会陆辰，转身登上潜水艇，扬长而去。
望着渐渐远去的潜水艇，陆辰暗自发誓无论如何也要追上他们，揭开背后隐藏的真相。
随后，陆辰再次前往了水舰队的基地。
在那水舰队基地深处，隐藏着一间坂木精心打造的密室。
这间密室仿佛与世隔绝，静静地等待着有缘人的到来。
进入密室后，首先映入眼帘的便是那颗散发着奇异光芒的大师球，它安静地放置在一处精致的展台上，宛如一件绝世珍宝。
而在其旁边，则摆放着一枚闪耀着璀璨金光的金珠，金珠的光芒与大师球相互映衬，使得整个密室都笼罩在了一层神秘的氛围之中。
陆辰深知自己目前还不是挑战坂木老大的最佳时机，毕竟，他需要先按部就班地推进剧情发展。且不说坂木本身就是个极其强大的对手，单从他的身份来看，就绝非等闲之辈。
表面上，坂木只是常磐道馆那个备受尊敬的馆主，因其卓越的实力和领导力，被人们誉为“大地的坂木”。
然而，在这光鲜亮丽的外表之下，他却有着另一重令人胆寒的身份——关东地区臭名昭着的黑恶势力火箭队的老大！
这个秘密一旦揭开，恐怕会令无数人为之震惊。
与此同时，在遥远的熔岩队基地内部，同样存在着一个极具影响力的人物——闪焰队首领弗拉达利。
说起闪焰队，那可是在卡洛斯地区赫赫有名的存在，他们的一举一动都牵动着当地居民的心弦。
而作为这支队伍的核心人物，弗拉达利原本拥有着充满慈爱与善良的性格。
然而，随着时间的推移，他目睹了太多人与人之间无休止的争执和抢夺，内心逐渐变得绝望起来。
面对这样残酷的现实，他开始萌生出一个极端的念头：只有大幅削减地球上的生命数量，才能让剩余的人类在一个没有纷争和掠夺的美好世界中继续生存下去。
为了实现这个疯狂的计划，弗拉达利不惜一切代价，甚至唤醒了三千年前被封印的最终兵器。
凭借着传说中的宝可梦哲尔尼亚斯及伊裴尔塔尔所蕴含的强大力量，他成功地激活了这件恐怖的武器，并妄图借助其毁灭一切生物，从而创造出他心目中那个所谓的理想国度。
坂木和弗拉达利都是极其强大的对手，陆辰深知自己目前还需要更多的历练来提升实力，因此决定稍后再去一同挑战他们，以便能够更好地应对可能出现的各种情况，并从中积累宝贵的战斗经验。
而此刻最为紧迫的任务，则是尽快完成水舰队相关的剧情线。
经过一番激烈的战斗，陆辰成功地击败了不少水舰队的小喽啰们。
在此期间，幸运之神眷顾着陆辰，让他意外地捡到了一台珍贵的技能学习机 97：狂舞挥打。
紧接着，陆辰一路披荆斩棘，终于抵达了水舰队基地的核心区域。
然而，此处却有一名水舰队的干部严阵以待。
面对强敌，陆辰毫无畏惧之色，凭借着精灵强大的实力，他轻轻松松便将这名干部击败在地。
从战败的干部口中，陆辰获知了一个惊人的消息——水梧桐早已前往神秘莫测的海底洞窟。
原来，之前所遭遇的一切都只是水梧桐精心设计的调虎离山之计罢了！
意识到事情的严重性后，陆辰迅速折返至水静市。
他毫不犹豫地施展【冲浪】技能，向着右侧疾驰而去。
一路上，陆辰遭遇了众多水上的训练家和他们麾下的精灵，但这些对手都无法阻挡他前进的步伐。
陆辰以雷霆万钧之势接连战胜了所有拦路者。
不久之后，陆辰顺利到达了猎人之家。
在这里，人们可以使用诸如红色碎片之类的特殊道具，来换取与之相对应的进化石。
继续向右前行，陆辰发现这片浅滩之上竟然还有位教授定点教学【踢倒】技能的格斗家。
随后，陆辰终于来到了绿岭市。
进入城市后，他首先直奔精灵中心，为经历多场恶战而疲惫不堪的精灵伙伴们进行治疗和恢复。
待精灵们重新焕发出勃勃生机后，陆辰沿着街道向上走去。
在一间屋子内，陆辰与一位少女经过一番友好交流，陆辰成功地从她那里获取了一件至关重要的道具——厉害钓竿。
在一间屋子里，和一位培育家对话，再前往茵郁市，与一个树屋内的男子对话。
最后，陆辰获得技能学习机78：杂技！
返回绿岭市后，在绿岭市右下角的区域有一个技能学习机91：精神场地。